Возникла проблема с АОНом, при звонках с части моих номеров отображается неправильный префикс. например 2250, хотя должен быть 4105. Если позвонить на неправильный префикс, то вызов не проходит, набираешь правильный и все ОК. Куда копать?

Копать в сторону схемы соединений, посмотреть что от вас уходит (если например у вас EDSS на потоке)
Помотрите таблицы dss1 dss1n sys.

Действовал по этой инструкции, но номера всё равно с другими префиксами
wp map 01 6 + - разрешаем использование глобального префикса.

lwp paddp 128*159 13 9 - устанавливаем максимальное число цифр, получаемого от встречной АТС АОНа (АТС будет забирать из запроса на установление соединения «9» цифр).

wl dss1n 0 + u u 12438 9 - включаем параметры автоматического определения номера и прописываем индекс цифрового набора станции, «Префикс АОН», который должен соответствовать индексу вашего узла связи.

«Префикс АОН» - Цифры номера, которые необходимо выдавать перед номером вызывающего абонента.
«Макс. цифр в АОН» – Общее количество цифр в информации о номере вызываемого абонента, выдаваемое в данный ИКМ тракт. Максимум 15 знаков.

Глобальный префикс в map никакого отношения не имеет к АОНу

Префикс АОН, прописанный Вами в dss1n в общем случае будет формировать Вам при звонках за пределы станции номер вызывающего абонента по схеме "Префикс АОН + списочный номер порта" общей длиной 9 цифр, то есть в Вашем примере 5 цифр префикса 12438 и плюс макс 4 цифры номера абонента в станции.
Может быть, у Вас просто разные префиксы для разных потоков прописаны?