У нас поставили АТС Меридиан 1 11С представитель фирмы установил и проверил все работало, а теперь мы сами не можем дать ей ума прога которую он оставил securecrt не работает или мы ей неможем дать ума подскажите пожалуйста какой прогой надо настраивать АТС?

SecureCRT вполне подходит для этой цели.
Как вы пытаетесь подключиться к станции: по сети или через COM-порт?

через Com порт

вроде бы сооединение есть в SecureCRT но невозможно написать комманды

Тогда скорее всего дело в настройках скорости и количестве информационных и стоповых бит.
Попробуйте подключиться к станционному порту с маркировкой PORT 0, посмотрите, какая выставлена скорость на процессорной плате станции и выставьте такую же на терминале. Количество бит: 8+1. И не забудьте про нуль-модем, если соединяетесь напрямую.